يعد قطاع الحماية من الأولويات الأساسية في المجتمعات المتأثرة بالأزمات والنزاعات المسلحة، حيث يتطلب توفير بيئة آمنة لضمان حقوق الإنسان وحمايته، خاصة للفئات الأكثر ضعفاً مثل الأطفال، النساء، وكبار السن. تسعى مؤسسة شباب أبين إلى تنفيذ مشاريع متعددة تهدف إلى تعزيز الحماية لهذه الفئات، من خلال إنشاء مساحات آمنة للأطفال في المدارس والمخيمات، وتقديم الدعم النفسي للمتضررين من النزاعات.
كما تقوم المؤسسة بتنفيذ أنشطة نظام إدارة الحالة لتوفير الدعم الاجتماعي للأفراد المحتاجين، إضافة إلى تدريب اليافعين على مهارات مهنية لتحسين أوضاعهم الاقتصادية. كما تتضمن جهود المؤسسة برامج توعية مجتمعية حول حقوق الإنسان والعنف القائم على النوع الاجتماعي، وتنظيم أنشطة ترفيهية لتخفيف الضغوط النفسية.
وتهتم المؤسسة أيضاً بحماية النساء من العنف من خلال برامج خاصة، فضلاً عن دعم المدارس ورياض الأطفال بالألعاب والأنشطة التي تعزز من بيئة تعليمية آمنة. من خلال هذه الأنشطة، تساهم مؤسسة شباب أبين في توفير الحماية وتعزيز حقوق الإنسان، مما يساعد على بناء مجتمع قادر على التعافي والنمو رغم التحديات